A região estuarina em torno da ilha de Vitória recebe aportes hídricos do mar e dos rios Santa Maria da Vitória, Bubu, Itanguá, Marinho e Aribiri. Nessa localidade, os maiores fatores de degradação ambiental são os aterros, ocupação desordenada as suas margens, algumas atividades industriais e portuárias e, o mais expressivo, que é o lançamento de esgotos, sendo a maioria in natura (1). Além do município de Vitória, a Baía de Vitória recebe também contribuições antrópicas de outros três municípios circunvizinhos: Vila Velha, Cariacica e Serra (2). Nos últimos anos, a ampliação industrial e a urbanização têm se intensificado, trazendo diversos impactos aos ambientes aquáticos, aumentando o despejo de esgotos e de outros meios contaminantes (3). Este aporte traz vários problemas, tais como o processo de eutrofização acelerado devido aumento das concentrações de nutrientes no corpo d`água, principalmente o nitrogênio e o fósforo (4). Dentre as várias consequências da eutrofização, está a floração intensificada de algas que produzem toxinas. Portanto, o prognóstico do efeito poluente do despejo de efluentes no sistema estuarino de Vitória é necessário para alcançar e manter níveis de qualidade desejados. No presente estudo, visa-se avaliar os pontos de poluição na Baía de Vitória e no Canal da Passagem através de indicadores como: matéria orgânica total, nutrientes dissolvidos e coliformes fecais. Dados de outros parâmetros também foram coletados para subsidiar a interpretação dos resultados.